《意見》指出，實施創新驅動發展戰略，基礎在縣域，活力在縣域，難點也在縣域。新形勢下，支持縣域開展以科技創新為核心的全面創新，發揮科技創新在縣域供給側結構性改革中的支撐和引領作用，打造發展新引擎，培育發展新動能，實現縣域經濟社會協調發展，對于建設創新型國家乃至全面建成小康社會意義重大。
《意見》強調，要強化科技與縣域經濟社會發展有效對接，打通從科技強、產業強到經濟社會發展強的通道。以建設創新型縣（市）和創新型鄉鎮為抓手，深入推動大眾創業、萬眾創新，構建多層次、多元化縣域創新創業格局，推動形成縣域創新創業新熱潮，促進縣域實現創新驅動發展。到2020年，縣域創新驅動發展環境顯著改善，創新驅動發展能力明顯增強，為我國建成創新型國家奠定基礎。
《意見》部署了縣域創新驅動發展的八項重點任務：一是加快產業轉型升級，促進縣域特色主導產業向綠色化、品牌化、高端化、集群化發展；二是培育壯大創新型企業，支持符合條件的高成長性科技企業上市；三是集聚創新創業人才，激發各類人才的創新創業活力；四是加強創新創業載體建設，在有條件的縣（市）建設創新型縣（市）、創新型鄉鎮；五是促進縣域社會事業發展，推動科技成果更多惠及民生改善；六是創新驅動精準扶貧精準脫貧，強化科技創新對精準扶貧精準脫貧的支撐引領作用；七是加大科學普及力度，切實提升農民科學素質；八是抓好科技創新政策落地，加強國家與地方科技創新政策有效銜接。
《意見》提出了縣域創新驅動發展的四方面保障措施：一是建立適應縣域創新驅動發展的組織領導體制和工作推進體系；二是加強對縣域創新驅動發展的政策扶持和項目支持；三是組織開展全國縣（市）創新能力監測；四是在推動縣域創新驅動發展中及時發現新典型、總結新模式、探索新機制。
