自2010年開始退役以來，已經拆除了63957噸設備和混凝土廢料。到2038年退役時，還需要拆除108,000噸設備。

2020年，在第二機組的渦輪大廳進行了大規模的拆除工作，拆除了97%的設備。大多數設備，在檢查放射性核素污染后，作為廢金屬在拍賣會上出售，其余的暫時儲存，直到可以送到倉庫永久儲存。

拆卸及去污工程由工廠人員進行，所有工程均按照批準的時間表進行。這項工作由伊格納里納(Ignalina)核電站退役國際基金和伊格納利納方案提供資金。

伊格納里納(Ignalina)核電站還在2020年拆除了一些未使用的建筑。11個建筑在現場被拆除，其中3個為特殊結構，7個為非特殊結構，1個為簡單結構。INPP表示，計劃在2021年拆除更多未使用的建筑。